Se aleja de las cinemáticas tradicionales para usar escenas estilo cómic interactivo con el arte de Ashley Wood. Mecánicas que Cambiaron la Franquicia
Lanzado en junio de 2010 en Europa, se sitúa en 1974, exactamente diez años después de los eventos de Metal Gear Solid 3: Snake Eater . Naked Snake, ahora conocido como Big Boss, lidera a los Militaires Sans Frontières (MSF) en Colombia hasta que una misteriosa solicitud lo lleva a Costa Rica . Ambientación: Plena Guerra Fría en Centroamérica.
Una fuerza militar desconocida ha ocupado Costa Rica, un país sin ejército, amenazando el equilibrio nuclear con una nueva arma IA.